有機肥生產過程中，因為原料來自于養(yǎng)殖業(yè)、農產品及食品加工殘渣、工業(yè)糟渣等，這些原料在儲存以及發(fā)酵過程中不可避免地會發(fā)生污水/滲濾液、臭氣等，設備機械的工作發(fā)生噪音、有機肥的烘干粉碎等深加工易發(fā)生粉塵和異味氣體等。 
　　下面介紹幾種有機肥臭氣處理的辦法： 
　　有機肥生產過程中的臭氣來源：有機肥生產中的臭氣來自原料腐爛變質、有機肥發(fā)酵和有機肥烘干等。有機肥生產中的惡臭物質種類多，來源廣泛，一般有氨味、硫化氫味等等，對動物呼吸、消化、心血管、內分泌及神經系統(tǒng)都會形成不同程度的毒害，某些臭氣即便無健康上的危害，也存在對人精力或心情上的刺激與影響。 
　　堆肥過程中臭氣發(fā)生階段：發(fā)生于發(fā)酵的最初階段，因為易分化有機物質的降解消耗很多氧氣，然后形成部分缺氧而發(fā)生小分子有機物質和硫化氫等。此時，因為pH較低不易發(fā)生氨蒸發(fā)，大約1-2周后，隨著堆肥pH值升高而呈現很多氨蒸發(fā)。此時，堆肥已逐步完結堆肥一次發(fā)酵。 
　　堆肥過程中臭氣抑制與消除：通過調節(jié)資料的通氣性、增加通風量和增加吸附資料等均可在程度上抑制臭氣的發(fā)生。但是，因為發(fā)酵資料數量大、臭氣發(fā)生集中和場所相對關閉等原因，致使發(fā)酵場所內臭氣濃度極高，有時場所內氨濃度高達mg/L以上。這也形成了很多營養(yǎng)的丟失。需要采納辦法收集和處理。 
　　建廠時，配套建設除臭設備或采納除臭辦法：近年來，隨著環(huán)境污染治理逐步完善，臭氣污染投訴越來越多。對蒸發(fā)性有機物的污染問題越來越關注，在工廠設施建設時，一起樹立恰當規(guī)模的除臭設備是避免空氣污染和減少與周邊居民發(fā)生膠葛的。如果無視除臭對策，等與周邊居民發(fā)生了膠葛或被環(huán)境部分批判后再進行建設，那時所花的費用將更多。 
　　目前，消除臭氣的辦法有很，如水洗法、化處理法、燃燒法、吸附法、空氣稀釋法、掩蔽法、臭氧氧化法、等離子體以及生物除臭法等。 
　　生產上用的較廣泛的一種就是生物除臭法，此種辦法則是在生物的效果下，通過生物化學反應來分化、轉化臭氣成分以到達除臭意圖。目前，應用最多的是使用微生物來處理臭氣。因而，也叫微生物除臭法。這種辦法的長處是工作成本低、節(jié)省能源與資源和易于保護等。